ドラッグストアで買った風邪薬や胃腸薬。レシートに「セルフメディケーション税制対象」とあるけれど、医療費控除と何が違うのか、どっちを使えばいいのか、迷いますよね。
通院が少ない年でも使える可能性があるのがこの税制です。ただし、使うには条件があり、医療費控除とは一緒に使えません。個人事業主は会社の健康診断がないぶん、条件の確認も自分で進める必要があります。
この記事では、元看護師のわたしが、対象の薬の見分け方、使える条件、どちらが有利かを決める手順を整理しました。年内に買う薬の考え方も入れています。
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- セルフメディケーション税制と医療費控除の違い（併用はできません）
- セルフメディケーション税制が使える2つの要件
- 対象医薬品の見分け方と、令和9年からの変更点
- どちらが有利かを決める3ステップ
- 年内に買う薬の考え方と、申告のしかた
本記事では、執筆時点（2026年11月）での一般的な情報をまとめています。ご自身の事業の状況に合っているかどうかは、お近くの税務署もしくは税理士さんに相談してみてくださいね！
同じ年に両方は使えないので、控除額が大きい方を選ぶのが基本です。
通院・入院・歯科などの医療費が多い年は、医療費控除が有利になりやすいです。通院はほとんどなく、対象の市販薬をよく買った年は、セルフメディケーション税制の出番になります。
医療費控除は、医療費の合計が10万円を超えないと使えません。年間の医療費が10万円に届かない人でも使える可能性があるのが、セルフメディケーション税制（医療費控除の特例）です。2つの違いを表にまとめました。
| 項目 | 医療費控除 | セルフメディケーション税制 |
|---|---|---|
| 対象になるもの | 治療・療養のための医療費（病院、薬局、通院の交通費など） | 対象の市販薬の購入費 |
| 控除額の計算 | 医療費の合計 − 10万円（総所得金額等が200万円未満の人は、10万円ではなく総所得金額等の5%） | 対象薬の購入額 − 12,000円 |
| 控除の上限 | 200万円 | 88,000円 |
| 追加の要件 | なし | 健診や予防接種などの「一定の取組」 |
| 併用 | どちらか一方を選ぶ（同じ年に両方は使えません） | |
使える条件は2つあります。「一定の取組」を行っていることと、対象薬の購入額が年12,000円を超えていることの両方が必要です。
一定の取組を、申告する本人が、その年に行う
取組として認められているのは、次のようなものです。
- インフルエンザなどの予防接種（定期接種を含む）
- 保険者が実施する健診・人間ドック
- 特定健康診査（メタボ健診）・特定保健指導
- 市区町村が行うがん検診
- 勤務先の定期健康診断（会社員の場合）
個人事業主は、勤務先の健診がありません。30代前半なら、インフルエンザなどの予防接種や、市区町村のがん検診（子宮頸がん検診など）が受けやすい取組です。
取組は、申告する本人が行う必要があります。お子さんや家族が受けても、代わりにはなりません。取組にかかった費用そのものも、控除の対象外です。
全額自己負担で受ける任意の健診は、取組と認められないことがあります。受ける前に、実施しているのが保険者や市区町村かを確認しておくと安心です。
対象医薬品の購入額が、年12,000円を超える
本人の分に、生計を一にする配偶者や親族の分を足して計算できます。12,000円を超えた部分が控除額で、上限は88,000円です。購入額が10万円で上限に届きます。
| 対象薬の年間購入額 | 控除額 | 節税額の目安（所得税10%・住民税10%の場合） |
|---|---|---|
| 12,000円 | 0円 | 0円 |
| 30,000円 | 18,000円 | 約3,600円 |
| 50,000円 | 38,000円 | 約7,600円 |
| 100,000円 | 88,000円（上限） | 約17,600円 |
所得控除なので、購入額や控除額がそのまま戻るわけではありません。戻るのは、控除額にかかる税金の分です。
対象かどうかは、薬の名前や効きそうなイメージでは判断できません。レシートの表示を軸に、パッケージのマークと厚生労働省の一覧で確認すると迷いにくいです。
対象商品には、商品名の横に★や◆などの印が付いたり、対象である旨が書かれたりします。表示のしかたはお店ごとに違います。
対象商品の多くには、共通のマークが付いています。マークがなくても対象のものがあるので、マークだけで判断しないようにします。
商品名で調べられます。一覧は定期的に更新されるので、購入前に最新のものを確認します。
「セルフメディケーション税制の対象ですか？」と聞けば、その場で確認してもらえます。
同じ名前のシリーズでも、錠剤・外用薬・成分の違いなどで、対象かどうかが分かれることがあります。薬は症状に合うものを先に選び、対象かどうかは商品ごとに確認するのが安全です。
レシートに対象の表示がないと、そのままでは申告に使えないことがあります。表示がない場合は、購入したお店に相談してください。
令和8年度の税制改正で、制度が見直されました。令和9年（2027年）1月1日以後に購入する分から、対象の範囲が広がります。
- スイッチOTC医薬品の分は、適用期限がなくなります。それ以外の対象医薬品は、令和13年12月31日までです。
- 胃腸薬・浣腸薬・便秘薬・痔の薬、生薬を有効成分とする咳止め・去痰薬などが、新たに対象に加わります。一部の検査キットも対象です。
- 痩身や美容の目的で使われやすい医薬品は、対象から除かれます。
有利な方は、医療費控除とセルフメディケーション税制の控除額を両方計算して、大きい方を選ぶと決められます。
病院・歯科・薬局への支払い、通院の交通費、治療のために買った市販薬を足します。保険金などで補てんされた分は引きます。
医療費控除は「医療費の合計 − 10万円」、セルフメディケーション税制は「対象薬の購入額 − 12,000円」です。
控除額が大きい方を選びます。
具体例で比べてみます。所得が200万円以上の人の場合です。
| ケース | 医療費控除 | セルフメディケーション税制 | 有利なのは |
|---|---|---|---|
| A：通院・歯科・処方薬が3万円、対象の市販薬が5万円 | 合計8万円で10万円に届かず、0円 | 5万円 − 12,000円 ＝ 38,000円 | セルフメディケーション税制 |
| B：通院・歯科・処方薬が15万円、対象の市販薬が5万円 | 合計20万円 − 10万円 ＝ 10万円 | 5万円 − 12,000円 ＝ 38,000円 | 医療費控除 |
| C：対象の市販薬が1万円だけ | 10万円に届かず、0円 | 12,000円以下で、0円 | どちらも使えない |
目安は、市販薬を含む医療費の合計が10万円（総所得金額等が200万円未満なら5%）に届くかどうかです。届かない年は、セルフメディケーション税制を検討する価値があります。
控除で戻る額や、10万円と5%のどちらが下限になるかは、その年の所得で決まります。年末をまたぐ報酬は、所得が変わることもあるので、先に整理しておくと計算がぶれません。
年またぎの報酬の扱いは、こちらで整理しています。
12月納品・1月入金の報酬はどう処理する？
いったん片方を選んで申告すると、あとから更正の請求や修正申告で、もう一方に切り替えることはできません。申告の前に、必ず両方を計算してください。
セルフメディケーション税制を選ぶと、病院や歯科に支払った治療費は控除に使えません。対象になるのは、対象薬の購入費だけです。
セルフメディケーション税制と一緒に使えないのは、医療費控除だけです。ふるさと納税、住宅ローン控除、生命保険料控除、iDeCoなどは別の制度なので、併用できます。
住宅ローン控除を使う個人事業主の方は、こちらもあわせて確認してください。
個人事業主の住宅ローン控除｜確定申告のやり方と注意点
この税制は、1月1日から12月31日までの1年間で判定します。年末までにやることを整理しました。
取組は、その年のうちに行う必要があります。まだ受けていないなら、年内にインフルエンザの予防接種やがん検診を受ければ、取組の要件は満たせます。12月は混みやすいので、早めの予約がおすすめです。
年内に期限がある手続きは、ほかにもあります。ふるさと納税の寄附もそのひとつです。
年内に寄附する場合の上限の目安は、こちらで計算できます。
【個人事業主向け】ふるさと納税シミュレーション｜上限目安
対象になるのは、その年の1月1日から12月31日までに支払った分です。年をまたいで合算はできません。年末にレシートを集めて、対象薬の合計が12,000円を超えているかを確認します。超えていない年は、この税制は使えません。
年末は、薬のレシートのほかに、年賀状やお歳暮の準備にかかった費用など、経費の整理も重なります。
年賀状・お歳暮の準備費用の扱いは、こちらで整理しています。
年賀状・お歳暮準備にかかった費用の仕訳【個人事業主向け】
今年（令和8年分）は、これまでの対象範囲のままです。胃腸薬でも、すでに対象になっているスイッチOTC医薬品はあります。新たに加わる薬は、令和9年1月1日以後の購入分からなので、年内に買う分は対象外のものがあります。購入前に、レシートの表示か一覧で確認してください。
12,000円に届かせるために、必要のない薬を買い足すのはおすすめできません。戻るのは購入額の一部で、薬には使用期限もあります。薬は症状に合わせて必要な分だけにして、症状が続くときは受診しましょう。
事業の確定申告をする人は、同じ確定申告書の中で、セルフメディケーション税制を一緒に申告します。所得税の申告をすれば、住民税にも反映されます。
対象薬のレシート・領収書と、健診結果や予防接種の記録は、申告期限から5年間は保管します。
対象薬の品名と金額を記入します。取組については、氏名、取組を行った年、実施した保険者や市区町村などの名称を書きます。
取組を証明する書類の添付は、今は不要です。ただし、税務署から求められたときに出せるよう、保管しておきます。
自分や家族の薬代は、事業の経費にはなりません。事業用の口座やカードで払ったときは、帳簿では「事業主貸」で処理するのが一般的です。
申告したあとの流れは、こちらで整理しています。
確定申告後にやることは？個人事業主の納税スケジュール
質問に答えていくだけで、仕訳が自動で作られるタイプの会計ソフトです。勘定科目や仕訳の意味から不安な人でも、まず記帳を始めやすいです。
仕訳の中身が見えるので、学びながら記帳したい人に向いています。
- セルフメディケーション税制と医療費控除は併用できないので、両方を計算して、控除額が大きい方を選びます。
- セルフメディケーション税制は、申告する本人の「一定の取組」と、対象薬の購入額が年12,000円超であることが要件です。控除の上限は88,000円です。
- 対象薬は、レシートの表示、パッケージのマーク、厚生労働省の一覧で確認します。
- 令和9年1月1日以後の購入分から、胃腸薬などに対象が広がります。
- 年内に、取組と購入額の合計を確認しておきましょう。
※本記事では、執筆時点（2026年11月）での一般的な情報をまとめています。ご自身の事業の状況に合っているかどうかは、お近くの税務署もしくは税理士さんに相談してみてくださいね！
どちらの控除を選ぶ場合も、申告の土台は1年分の記録です。会計ソフトは年会費がかかるデメリットはありますが、手書きに比べて格段に手軽です。パソコン・スマホ・マイナンバーカードがあれば、家から一歩も出ずに確定申告まで進められます。
簿記の知識がなくても始めやすいのは、【freee会計】です。質問に答えるだけで仕訳ができるので、まず記帳を始めたい人に向いています。
もし簿記の知識があるなら、マネフォの方がおすすめです。日商簿記2級のわたしはマネフォの方が使いやすいので、今も愛用中です。記帳と確定申告もマネフォで行い、半月に1度まとめて入力することで、記帳の手間と心理的な負担を減らしています。
開業当初の1か月だけ、freeeを使っていました。初心者向けのつくりなので、簿記の知識がある人にはやや使いづらい面もありました。
税理士を探している方へ｜税理士紹介エージェント
「どちらの控除が有利か、確認してから申告したい」「申告まで相談したい」というときは、税理士さんに頼る方法もあります。希望に合う税理士を紹介してもらえるサービスです。
記帳作業を任せたい方へ｜記帳代行お助けマン
日々の帳簿入力を外部に任せられる、記帳入力のアウトソーシングサービスです。対応エリアなどの条件は、サービスのページで確認してください。
参考：国税庁タックスアンサー No.1120・No.1122・No.1129、厚生労働省「セルフメディケーション税制に関するQ&A」（令和8年8月7日現在）、令和8年度税制改正（2026年11月時点）
